北理工课题组研究揭示SMURF1通过促进受损溶酶体自噬降解维持细胞稳态

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近日,星空手机网页版登录入口,星空(中国)生命学院董磊教授课题组在自噬领域顶级期刊《Autophagy》最新发表题为“SMURF1 mediates damaged lysosomal homeostasis by ubiquitinating PPP3CB to promote the activation of TFEB”的研究论文。

巨自噬/自噬是通过形成自噬体和自噬溶酶体(成熟自噬体与溶酶体融合形成)来降解细胞内受损的细胞器和/或错误折叠蛋白的重要的细胞循环过程,并参与各种生理和病理过程。自噬转录因子TFEB通过与溶酶体表达和调控(CLEAR)基序的靶基因结合,也在溶酶体稳态中发挥关键作用。先前的研究发现MTORC1(MTOR复合物1)、RRAG、TRIM16、LC3脂质化和 SMURF1在不同条件下参与TFEB的核转运。一般来说,TFEB(S211)可以被在溶酶体表面的MTORC1激酶磷酸化,然后与YWHA(酪氨酸3-单氧酶/色氨酸5-单氧酶激活蛋白)/14-3-3结合,导致其在细胞质中滞留。且溶酶体受损会通过以ATG依赖的方式选择性地损害 MTORC1介导的TFEB S211磷酸化减少,降低与YWHA/14-3-3的结合。另外,PPP3/calcineurin 是唯一受细胞内钙调控的丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶。活化的PPP3/calcineurin会使细胞质中的TFEB去磷酸化,会导致其核转位并激活自噬相关基因。然而,在溶酶体损伤情况下如何调节TFEB激活的联动分子机制仍尚未清楚。

星空手机网页版登录入口,星空(中国)生命学院董磊教授团队前期发现阻断SMURF1(SMAD特异性E3泛素蛋白连接酶通过抑制TFEB的核转运,从而阻碍对溶酶体损伤的自噬生成。半乳糖凝集素(galectins)识别内膜溶酶体的损伤信号,导致SMURF1和PPP3/calcineurin被招募到溶酶体上,形成了LGALS3- SMURF1-PPP3/calcineurin复合体,该复合体能够稳定TFEB,从而去磷酸激活TFEB并进行溶酶体生成相关基因的表达。SMURF1作为一个连接环境压力和自噬/自溶酶体联动的核心蛋白,参与调控了TFEB的激活。

该课题组最新发表的研究论文进一步阐释了钙离子依赖磷酸酶PPP3/calcineurin在溶酶体稳态调控中复合物形成中的“桥梁”作用与SMURF1的协同机制。首先,PPP3CB作为桥梁,在溶酶体损伤后通过与LGALS3结合,招募SMURF1,形成LGALS3- SMURF1-PPP3/calcineurin复合体。其中,PPP3CB通过去磷酸化LGALS3的方式促进LGALS3开放构象的形成,增加NT(N端尾部结构域)和CRD(C端碳水化合物识别域)之间的解离。此外,SMURF1能够泛素化修饰PPP3CB(蛋白磷酸酶3催化亚基β)促进受损溶酶体的自噬降解。在受到细胞内的钙信号刺激时,PPP3CB的第146位赖氨酸处被招募的SMURF1泛素化。SMURF1对PPP3CB的K63泛素化增强了对TFEB的招募。另一方面,活化的PPP3CB和调节亚基PPP3R1直接与TFEB相互作用,促进TFEB的构象校正,进而激活TFEB靶向基因的转录(图1)。

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图1 SMURF1参与溶酶体损伤后受损溶酶体清除过程的示意图(图源自于Autophagy)

这项研究揭示了PPP3CB及其泛素连接酶SMURF1对溶酶体损伤的细胞应激响应的关键机制,解析TFEB在溶酶体损伤情况下亚细胞定位的通路的分子机制在未来有利于SMURF1作为治疗应激相关疾病的潜在药物靶点的可行性。

原文链接:https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15548627.2024.2407709


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